Озеро Ван расположено на высоте 1648 м над уровнем моря, имеет неправильную форму, немного близкую к треугольнику. Ширина озера в самой широкой его части составляет 119 километров. Озеро делится узким перешейком на небольшую и очень неглубокую, северную часть и на крупную южную часть, где глубины достигают 451 метра. Средняя глубина озера Ван составляет 161,2 метра.